28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1555 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  100 
 
 
104 aa  213  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  81.73 
 
 
104 aa  184  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  58.65 
 
 
104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  46.6 
 
 
102 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  46.6 
 
 
102 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  46.6 
 
 
102 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3105  plasmid maintenance protein CcdB  35.58 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  36.54 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3544  plasmid maintenance protein CcdB  38.1 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  35.58 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  39.42 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  39.42 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  39.42 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3040  plasmid maintenance protein CcdB  38.1 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  37.14 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0036  plasmid maintenance protein CcdB  32.69 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.78995 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  34.29 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  35.24 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0037  plasmid maintenance protein CcdB  37.21 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684176  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  30.84 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  30.77 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  36.45 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  37.08 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  31.03 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  30.39 
 
 
102 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  30.48 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  28.41 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4237  hypothetical protein  33.02 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.205088  normal  0.553422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>