22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0036 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0036  plasmid maintenance protein CcdB  100 
 
 		 101 aa  207  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.78995 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  82.18 
 
 		 101 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  82.18 
 
 		 101 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  81.19 
 
 		 101 aa  173  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0037  plasmid maintenance protein CcdB  79.76 
 
 		 84 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3040  plasmid maintenance protein CcdB  58.42 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  57.43 
 
 		 101 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  57.43 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3105  plasmid maintenance protein CcdB  57.43 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3544  plasmid maintenance protein CcdB  56.44 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  55.45 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  38.83 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  38.83 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  38.83 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  38.61 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  32.69 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  34.62 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  33.65 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  37 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  28.16 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  27.62 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>