26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0252 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  97.03 
 
 		 101 aa  203  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  97.03 
 
 		 101 aa  203  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0036  plasmid maintenance protein CcdB  81.19 
 
 		 101 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.78995 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0037  plasmid maintenance protein CcdB  95.24 
 
 		 84 aa  167  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  58.42 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  58.42 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3105  plasmid maintenance protein CcdB  57.43 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3040  plasmid maintenance protein CcdB  57.43 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  56.44 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3544  plasmid maintenance protein CcdB  56.44 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  45.63 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  45.63 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  45.63 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  39.42 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  37.5 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  35.05 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  34.62 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  29.13 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  29.13 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  30.1 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  28.85 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  28 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  27.45 
 
 		 105 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  31.71 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>