26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0056 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  100 
 
 
101 aa  208  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  100 
 
 
101 aa  208  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  97.03 
 
 
101 aa  203  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0036  plasmid maintenance protein CcdB  82.18 
 
 
101 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.78995 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0037  plasmid maintenance protein CcdB  97.62 
 
 
84 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684176  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  59.41 
 
 
101 aa  133  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3105  plasmid maintenance protein CcdB  58.42 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  59.41 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3040  plasmid maintenance protein CcdB  58.42 
 
 
101 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  57.43 
 
 
101 aa  130  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3544  plasmid maintenance protein CcdB  57.43 
 
 
101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  46.15 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  46.15 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  46.15 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  39.42 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  38.46 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  34.69 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  35.58 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  30.1 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  27.45 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  28.57 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  27.18 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  27.72 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  26.47 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  31.71 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>