29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1255 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  100 
 
 
102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  40.38 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  41.35 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  41.35 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  35.29 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  36.79 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  35.64 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  35.64 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  35.64 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  33.33 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  31.37 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  35.85 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  35.58 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  31.37 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  33.98 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  40.74 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  31.07 
 
 
104 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  30.39 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  31.37 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  30.39 
 
 
104 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  28 
 
 
101 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  27.72 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  27.72 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4237  hypothetical protein  27.36 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.205088  normal  0.553422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3372  hypothetical protein  31.76 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  28 
 
 
101 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3105  plasmid maintenance protein CcdB  27 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3544  plasmid maintenance protein CcdB  27 
 
 
101 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  28 
 
 
101 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>