19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4237 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4237  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.205088  normal  0.553422 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  45.92 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  37.11 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  35.71 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  30 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  30 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  30 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  33.98 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  30.48 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  38.61 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  34.95 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  34.65 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  27.36 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  33.01 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  33.02 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  31.13 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  26 
 
 		 101 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>