20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3183 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  100 
 
 		 98 aa  197  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  43.43 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  44.44 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  48.04 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  44 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  36.47 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  36.47 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  36.47 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4237  hypothetical protein  37.11 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.205088  normal  0.553422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  36.54 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  34.34 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  40.38 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3552  hypothetical protein  56.82 
 
 		 45 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  33.65 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  50.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  33.96 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  31.37 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  31.03 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>