15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5522 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5522  putative CcdB cytotoxin-like protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0819956  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  33.98 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  38.1 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  36.11 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  32.04 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  35.24 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  30.77 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  30.48 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  40.28 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  29.59 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  29.59 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  29.59 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  27.36 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  26.42 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3372  hypothetical protein  33.65 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>