More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4207 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4207  aldo/keto reductase  100 
 
 
259 aa  517  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.919158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2857  aldo/keto reductase  62.85 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2834  aldo/keto reductase  60.16 
 
 
259 aa  291  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  44.96 
 
 
274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.17 
 
 
282 aa  211  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14880  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.83 
 
 
280 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00385418  normal  0.25343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  45.25 
 
 
276 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  46.09 
 
 
274 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  46.09 
 
 
278 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  46.12 
 
 
280 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  44.79 
 
 
277 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  42.35 
 
 
275 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  41.9 
 
 
276 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  45.71 
 
 
274 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  41.86 
 
 
279 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  41.92 
 
 
282 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2618  aldo/keto reductase  45.31 
 
 
274 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  42.31 
 
 
282 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  41.92 
 
 
282 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  43.08 
 
 
279 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  40.94 
 
 
276 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  45.35 
 
 
281 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  44.14 
 
 
278 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  42.69 
 
 
275 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  43.75 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  43.97 
 
 
276 aa  198  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  42.29 
 
 
274 aa  197  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  38.67 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  40.77 
 
 
281 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  38.61 
 
 
276 aa  194  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.53 
 
 
282 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  43.14 
 
 
272 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.61 
 
 
275 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0272  aldo/keto reductase  41.76 
 
 
281 aa  193  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.199766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.35 
 
 
279 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  44.92 
 
 
277 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2688  aldo/keto reductase  43.24 
 
 
278 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0264526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  38.61 
 
 
276 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  41.76 
 
 
283 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  41.76 
 
 
283 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1858  aldo/keto reductase  39.16 
 
 
297 aa  191  7e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  42.64 
 
 
294 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  43.14 
 
 
276 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.98 
 
 
279 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  43.41 
 
 
281 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.74 
 
 
275 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  41.76 
 
 
283 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  41.57 
 
 
272 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  45.35 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.45 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.13 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.06 
 
 
277 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.52 
 
 
275 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  44.96 
 
 
278 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.45 
 
 
275 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1687  2,5-didehydrogluconate reductase  44.02 
 
 
258 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  36.68 
 
 
274 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  41.47 
 
 
278 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.7 
 
 
357 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  43.02 
 
 
276 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0262  2,5-didehydrogluconate reductase  43.3 
 
 
276 aa  188  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  44.03 
 
 
278 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.74 
 
 
275 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.31 
 
 
312 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4075  aldo/keto reductase  44.36 
 
 
277 aa  188  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  39.92 
 
 
282 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  42.91 
 
 
276 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.61 
 
 
275 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.74 
 
 
275 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1850  2,5-didehydrogluconate reductase  45.49 
 
 
277 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.671813  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  41.18 
 
 
272 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0265  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
281 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.31 
 
 
274 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.35 
 
 
275 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.52 
 
 
275 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.35 
 
 
275 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  39.15 
 
 
282 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.35 
 
 
275 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.84 
 
 
275 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3785  Aldehyde reductase  38.28 
 
 
267 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.52 
 
 
275 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.52 
 
 
275 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  38.52 
 
 
275 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.52 
 
 
275 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  38.52 
 
 
275 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.52 
 
 
275 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  41.11 
 
 
299 aa  185  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6248  2,5-didehydrogluconate reductase  37.35 
 
 
278 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1875  2,5-didehydrogluconate reductase  38.74 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.45 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  41.67 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12350  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  41.76 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1839  2,5-didehydrogluconate reductase  38.74 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.52 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1540  aldo/keto reductase  43.97 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.199224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4023  aldo/keto reductase  40 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0487  aldo/keto reductase  41.54 
 
 
277 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  39.68 
 
 
273 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.28 
 
 
281 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>