169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1471 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1471  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1774  Ferritin, Dps family protein  66.67 
 
 
174 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5518  Ferritin Dps family protein  63.92 
 
 
177 aa  202  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0082  Ferritin Dps family protein  53.99 
 
 
187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0171  Ferritin Dps family protein  52.35 
 
 
183 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  50.3 
 
 
196 aa  174  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  50.3 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3490  Ferritin Dps family protein  49.14 
 
 
176 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13875  bacterioferritin bfrB  49.7 
 
 
181 aa  163  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321537  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2235  Ferritin Dps family protein  48.43 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000308738  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3193  Ferritin Dps family protein  46.75 
 
 
192 aa  158  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5419  Ferritin, Dps family protein  49.03 
 
 
181 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920475  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5039  Ferritin and Dps  48.39 
 
 
181 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5127  Ferritin, Dps family protein  48.39 
 
 
181 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1141  Ferritin, Dps family protein  49.35 
 
 
187 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.406209  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3258  Ferritin, Dps family protein  48.73 
 
 
196 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000744438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  40.28 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  37.32 
 
 
166 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  39.2 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  35.92 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  38.17 
 
 
170 aa  94.4  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  35.92 
 
 
167 aa  94  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  33.54 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  37.78 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  31.52 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  30.59 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  35.38 
 
 
170 aa  89  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  29.37 
 
 
162 aa  88.6  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  34.25 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  30.99 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  31.97 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  35.38 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  33.1 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  32.33 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  32.88 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  32.64 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  31.94 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  33.33 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  36.07 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  30.46 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  33.08 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  32.64 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  28.15 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  33.33 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  34.69 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  29.01 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  30.43 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  28.87 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  33.08 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  37.04 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  37.04 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  37.04 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  37.04 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  37.04 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  34.01 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  30.94 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  32.87 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  25.32 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  30.53 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  30.28 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 
477 aa  74.3  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  28.17 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  32.31 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  31.14 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  29.5 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  33.83 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  32.23 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  28.17 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  34.51 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  28.46 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  28.46 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  30.63 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  28.46 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1286  ferritin  31.85 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  29.25 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  31.13 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  31.16 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  28.87 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  36.04 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  30 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  30 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  29.41 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  30 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  30 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  29.23 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  29.17 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  27.91 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  29.23 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  29.03 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  31.58 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>