183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2519 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 172 aa  358  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  98.26 
 
 		 172 aa  353  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  77.78 
 
 		 171 aa  256  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  69.94 
 
 		 173 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  63.95 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  62.65 
 
 		 173 aa  224  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  62.65 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  58.79 
 
 		 171 aa  201  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  54.39 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  54.17 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  53.33 
 
 		 169 aa  187  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  49.7 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  54.17 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  52.07 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  55.95 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  51.5 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  50.3 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  50 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  50 
 
 		 173 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  48.48 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  53.09 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  47.9 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  48.52 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  49.11 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  56.02 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  51.55 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  49.69 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  53.29 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  47.59 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  51.55 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  47.83 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  47.83 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  49.4 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  46.54 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  49.07 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  49.07 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  50.92 
 
 		 163 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  52.33 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  45.28 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  48.19 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  48.19 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  49.69 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  45.34 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  43.64 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  48.19 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  45.34 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  45.62 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  46.58 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  47.31 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  44.58 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  47.74 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  47.74 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  43.27 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  47.1 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  47.74 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  43.98 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  49.07 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  42.35 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  43.67 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  44.03 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  43.67 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  42.77 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  43.67 
 
 		 169 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  43.67 
 
 		 169 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  43.67 
 
 		 169 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  44.38 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  42.17 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  40.88 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  39.75 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  40.88 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  40.25 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  40.88 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  41.82 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  43.04 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  40.48 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  39.62 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  40.25 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  41.25 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  42.33 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  42.33 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  42.76 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  40.88 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  40.88 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  40.88 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  40.88 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  44.94 
 
 		 477 aa  129  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  40.25 
 
 		 178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  40.25 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>