183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1047 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  100 
 
 
170 aa  349  8e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  97.65 
 
 
170 aa  342  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  52.41 
 
 
171 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  47.02 
 
 
170 aa  177  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  50.89 
 
 
172 aa  174  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  47.02 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  49.7 
 
 
172 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  48.24 
 
 
171 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  49.11 
 
 
172 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  48.5 
 
 
173 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  45.56 
 
 
176 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  50.6 
 
 
171 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  51.2 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  51.2 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  51.2 
 
 
168 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  47.2 
 
 
162 aa  160  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  47.2 
 
 
163 aa  159  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  50 
 
 
168 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  47.2 
 
 
163 aa  157  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  49.09 
 
 
168 aa  157  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  43.35 
 
 
175 aa  156  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  46.91 
 
 
166 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  50.6 
 
 
169 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  45.61 
 
 
175 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  46.54 
 
 
167 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  43.71 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  46.88 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  49.7 
 
 
186 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  45.45 
 
 
169 aa  150  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  45.51 
 
 
174 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  47.83 
 
 
162 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  43.11 
 
 
172 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  45.34 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  42.24 
 
 
162 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  41.76 
 
 
177 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  43.37 
 
 
173 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  42.14 
 
 
167 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  42.04 
 
 
168 aa  142  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  46.15 
 
 
477 aa  141  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  41.21 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  40.96 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  40.99 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  44.72 
 
 
164 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  46.39 
 
 
164 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  44.72 
 
 
164 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  44.97 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  43.95 
 
 
164 aa  134  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  45.06 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  42.94 
 
 
163 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  38.55 
 
 
176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  42.77 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  42.51 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  43.56 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  43.56 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 
178 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 
178 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 
178 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  39.62 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  39.62 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  39.62 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  39.62 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  41.61 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  39.62 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  38.99 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  37.71 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  42.41 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  38.99 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  38.99 
 
 
178 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  38.36 
 
 
174 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  38.99 
 
 
178 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  38.99 
 
 
175 aa  124  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  39.52 
 
 
170 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  45.96 
 
 
164 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  37.74 
 
 
175 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  43.56 
 
 
166 aa  120  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  38.12 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  40.37 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  36.97 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  40 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  33.93 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  33.93 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  35.54 
 
 
172 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  35.22 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  35.12 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  37.04 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  37.82 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  34.38 
 
 
165 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  35.93 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  35.93 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  35.93 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  34.38 
 
 
165 aa  111  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  40.13 
 
 
168 aa  111  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>