183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1431 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  100 
 
 
166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  80.72 
 
 
166 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  80.72 
 
 
166 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  57.06 
 
 
168 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  57.06 
 
 
168 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  57.06 
 
 
168 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  56.44 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  56.44 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  56.44 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  56.44 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  56.44 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  56.44 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  56.44 
 
 
168 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  44.58 
 
 
168 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  44.65 
 
 
167 aa  143  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  43.56 
 
 
172 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  44.17 
 
 
170 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  42.33 
 
 
172 aa  140  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  43.56 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  42.33 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  43.64 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  45.62 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  44.03 
 
 
167 aa  138  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  42.07 
 
 
171 aa  137  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  41.46 
 
 
176 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  41.1 
 
 
170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  39.63 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  40.52 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  43.56 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  40.24 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  41.72 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  40.79 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  39.63 
 
 
173 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  40.99 
 
 
162 aa  128  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  39.47 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  39.13 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  40.49 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  35.62 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  36.88 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  40.12 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  39.88 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  38.51 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  35.44 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  37.82 
 
 
164 aa  125  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  35.44 
 
 
169 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  39.88 
 
 
171 aa  124  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  35.44 
 
 
169 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  35.44 
 
 
169 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  35.22 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  35.22 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  35.22 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  33.33 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  35.22 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  37.89 
 
 
169 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  34.59 
 
 
178 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  34.59 
 
 
175 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  35.22 
 
 
178 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  38.27 
 
 
162 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  33.33 
 
 
175 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  40.24 
 
 
186 aa  121  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  34.59 
 
 
178 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  34.59 
 
 
178 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  34.59 
 
 
178 aa  121  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  36.25 
 
 
165 aa  120  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  37.2 
 
 
177 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  36.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  36.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  39.22 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  39.22 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  36.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  36.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  34.59 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  36.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  36.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  36.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  32.73 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  38.04 
 
 
171 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  36.25 
 
 
165 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  36.88 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  36.88 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  36.88 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  39.76 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  36.14 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  36.71 
 
 
172 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  36.88 
 
 
165 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  36.88 
 
 
165 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  32.73 
 
 
175 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  34.18 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  36.65 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  38.41 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  34.59 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  38.51 
 
 
161 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  33.54 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  32.7 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  39.88 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  36.48 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  39.13 
 
 
160 aa  113  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  37.65 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  32.72 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  35.8 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>