180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0804 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0804  ferritin  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  83.23 
 
 
167 aa  280  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  83.23 
 
 
167 aa  280  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  83.23 
 
 
167 aa  279  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  55.13 
 
 
175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  51.83 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  51.83 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  51.83 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  51.83 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  51.83 
 
 
178 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  51.83 
 
 
178 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  51.83 
 
 
178 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  51.83 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  53.85 
 
 
175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  52.17 
 
 
169 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  52.17 
 
 
169 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  52.17 
 
 
169 aa  180  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  51.22 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  51.83 
 
 
165 aa  179  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  50.61 
 
 
181 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  50.31 
 
 
161 aa  178  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  52.17 
 
 
169 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  49.69 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  51.55 
 
 
175 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  52.17 
 
 
168 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  52.17 
 
 
168 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  50.93 
 
 
166 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  50.31 
 
 
175 aa  175  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  48.17 
 
 
175 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  51.28 
 
 
175 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  50.64 
 
 
175 aa  174  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  48.78 
 
 
174 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  50 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  49.07 
 
 
165 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  49.07 
 
 
165 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  49.07 
 
 
165 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  49.07 
 
 
165 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  49.07 
 
 
165 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  47.2 
 
 
165 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  47.2 
 
 
165 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  47.2 
 
 
165 aa  167  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  47.2 
 
 
165 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  47.2 
 
 
165 aa  167  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  47.2 
 
 
165 aa  167  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  47.2 
 
 
165 aa  167  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  49.07 
 
 
175 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  46.58 
 
 
165 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  47.2 
 
 
165 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  47.2 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  40.99 
 
 
162 aa  147  5e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  45.51 
 
 
170 aa  143  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  47.1 
 
 
172 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  43.59 
 
 
171 aa  143  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  46.45 
 
 
172 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  41.88 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  37.04 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  45.51 
 
 
171 aa  137  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  42.95 
 
 
176 aa  136  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  40.99 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.87 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  44.52 
 
 
173 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  41.82 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  41.29 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  37.04 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  41.98 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  39.35 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  37.04 
 
 
171 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  41.77 
 
 
164 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  42.47 
 
 
168 aa  120  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  40.82 
 
 
175 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  40.65 
 
 
176 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  41.03 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  37.18 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  38.75 
 
 
162 aa  118  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  40.14 
 
 
175 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  36.42 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  36.2 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  40.38 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  39.87 
 
 
165 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  39.73 
 
 
175 aa  117  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  38.61 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  41.29 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  39.1 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  42.59 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  37.97 
 
 
164 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  40 
 
 
160 aa  114  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  35.44 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  38.36 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  39.35 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  39.35 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  34.59 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  38.71 
 
 
168 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  38.71 
 
 
168 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  38.71 
 
 
168 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  38.71 
 
 
168 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  38.71 
 
 
168 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  38.71 
 
 
168 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  38.71 
 
 
168 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  34.81 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>