183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2910 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  100 
 
 
171 aa  358  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  77.78 
 
 
172 aa  285  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  77.78 
 
 
172 aa  285  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  75.3 
 
 
173 aa  276  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  64.88 
 
 
173 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  64.33 
 
 
176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  60.84 
 
 
176 aa  222  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  56.14 
 
 
171 aa  207  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  57.58 
 
 
171 aa  200  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  50.89 
 
 
171 aa  189  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  52.12 
 
 
169 aa  185  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  53.85 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  48.21 
 
 
168 aa  177  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  49.71 
 
 
177 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  55.42 
 
 
169 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  50.3 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  56.89 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  47.31 
 
 
173 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  50.31 
 
 
164 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  48.81 
 
 
171 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  46.15 
 
 
170 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  43.64 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  52.41 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  49.08 
 
 
164 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  44.91 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  46.11 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  46.11 
 
 
175 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  44.97 
 
 
170 aa  158  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  44.64 
 
 
174 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  47.2 
 
 
163 aa  157  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  45.06 
 
 
164 aa  157  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  47.83 
 
 
162 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  46.58 
 
 
163 aa  155  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  44.72 
 
 
165 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  47.85 
 
 
163 aa  153  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  46.71 
 
 
168 aa  153  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  48.45 
 
 
162 aa  153  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  46.71 
 
 
168 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  46.71 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  46.71 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  46.71 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  46.71 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  46.71 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  46.71 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  47.65 
 
 
175 aa  151  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  44.1 
 
 
161 aa  151  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  45.06 
 
 
166 aa  151  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  45.51 
 
 
172 aa  151  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  44.65 
 
 
167 aa  150  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  46.39 
 
 
168 aa  150  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  46.11 
 
 
168 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  42.24 
 
 
164 aa  148  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  43.4 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  42.42 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  43.12 
 
 
163 aa  145  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  38.69 
 
 
172 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  41.18 
 
 
172 aa  142  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  43.48 
 
 
162 aa  141  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  42.51 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  44.52 
 
 
164 aa  137  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  45.96 
 
 
164 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  37.27 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  39.87 
 
 
172 aa  134  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  43.23 
 
 
167 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  43.23 
 
 
167 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  41.51 
 
 
175 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  43.23 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  40.12 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  39.24 
 
 
176 aa  132  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  39.62 
 
 
175 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  38.36 
 
 
175 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  40 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  40 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  40 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  40 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  40 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  39.38 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  39.38 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  39.38 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  40 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  40 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  37.06 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  41.61 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  37.65 
 
 
175 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  40 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  40 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  40 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  40 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  40 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  38.75 
 
 
175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  40 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  37.5 
 
 
168 aa  127  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  38.99 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  37.5 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  38.99 
 
 
178 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  40.37 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  35.43 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  38.99 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 
477 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>