179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4766 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  94.25 
 
 		 175 aa  343  8e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  93.57 
 
 		 174 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  91.86 
 
 		 175 aa  331  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  81.61 
 
 		 178 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  81.61 
 
 		 178 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  81.61 
 
 		 178 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  81.61 
 
 		 178 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  82.08 
 
 		 178 aa  306  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  81.5 
 
 		 178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  82.94 
 
 		 175 aa  305  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  81.5 
 
 		 178 aa  303  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  81.5 
 
 		 178 aa  303  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  81.5 
 
 		 178 aa  303  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  77.14 
 
 		 175 aa  285  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  76.57 
 
 		 175 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  77.65 
 
 		 175 aa  282  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  73.53 
 
 		 181 aa  268  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  70.18 
 
 		 175 aa  262  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  67.68 
 
 		 172 aa  245  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  66.67 
 
 		 169 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  66.67 
 
 		 169 aa  238  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  66.67 
 
 		 169 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  63.1 
 
 		 169 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  62.65 
 
 		 166 aa  231  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  63.19 
 
 		 168 aa  230  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  62.8 
 
 		 168 aa  230  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  62.73 
 
 		 161 aa  229  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  217  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  60.87 
 
 		 165 aa  217  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  59.88 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  61.49 
 
 		 165 aa  214  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  56.8 
 
 		 175 aa  213  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  50.61 
 
 		 167 aa  180  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  50.61 
 
 		 167 aa  180  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  50 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  50 
 
 		 164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  46.79 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  43.2 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  45 
 
 		 170 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  44.1 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  47.5 
 
 		 171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.38 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  42.14 
 
 		 176 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  42.77 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  37.82 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  41.98 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  40.88 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  45.28 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  39.62 
 
 		 172 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  39.62 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  39.76 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  38.99 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  40.85 
 
 		 164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  38.12 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  44.03 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  38.75 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  41.25 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  36.09 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  38.99 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  40 
 
 		 171 aa  124  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  38.36 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  37.11 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  37.74 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  37.74 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  41.36 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  36.88 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  39.24 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  33.96 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  37.5 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  35.43 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  36.2 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  35.58 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  39.61 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  38.12 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  40.12 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  34.62 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  35 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  35 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  40.88 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  34.38 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  35 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  35 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  35 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>