181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00534 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  100 
 
 
175 aa  362  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  97.14 
 
 
175 aa  353  6.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  88.51 
 
 
181 aa  328  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  84 
 
 
175 aa  310  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  80.59 
 
 
175 aa  290  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  79.41 
 
 
175 aa  288  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  79.41 
 
 
174 aa  287  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  77.14 
 
 
175 aa  285  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  74.29 
 
 
175 aa  278  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  76.16 
 
 
178 aa  279  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  76.61 
 
 
178 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  76.61 
 
 
178 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  76.61 
 
 
178 aa  278  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  75.58 
 
 
178 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  75.58 
 
 
178 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  75.58 
 
 
178 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  75.58 
 
 
178 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  75.29 
 
 
175 aa  275  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  75 
 
 
178 aa  275  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  70.83 
 
 
169 aa  258  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  70.83 
 
 
169 aa  258  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  70.83 
 
 
169 aa  258  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  69.64 
 
 
172 aa  258  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  68.45 
 
 
169 aa  247  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  70.99 
 
 
166 aa  246  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  67.26 
 
 
168 aa  245  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  67.26 
 
 
168 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  63.98 
 
 
161 aa  229  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  64.2 
 
 
165 aa  226  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  63.35 
 
 
165 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  63.35 
 
 
165 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  62.73 
 
 
165 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  62.73 
 
 
165 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  62.73 
 
 
165 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  60.87 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  62.73 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  60.25 
 
 
165 aa  216  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  59.76 
 
 
175 aa  210  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  53.7 
 
 
167 aa  185  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  53.7 
 
 
167 aa  185  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  53.7 
 
 
167 aa  185  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  53.85 
 
 
164 aa  181  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  51.28 
 
 
162 aa  179  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  48.15 
 
 
166 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  46.25 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  42.6 
 
 
172 aa  147  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  43.75 
 
 
169 aa  141  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  45.62 
 
 
171 aa  140  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  36.9 
 
 
176 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  39.51 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  41.82 
 
 
165 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  38.86 
 
 
171 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  42.14 
 
 
176 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  36.57 
 
 
173 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  40.25 
 
 
172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  43.12 
 
 
164 aa  127  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  38.46 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  40.88 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  42.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  38.99 
 
 
172 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  38.99 
 
 
170 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  38.36 
 
 
170 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  40.25 
 
 
167 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  37.11 
 
 
172 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  39.16 
 
 
166 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  38.75 
 
 
175 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  37.36 
 
 
171 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  38.75 
 
 
175 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  38.75 
 
 
175 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  38.99 
 
 
167 aa  120  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  39.24 
 
 
163 aa  120  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  37.74 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  34.86 
 
 
171 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  40.25 
 
 
168 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  36.25 
 
 
173 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  36.81 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  38.41 
 
 
165 aa  117  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  37.5 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  38.12 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  36.88 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 
169 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  37.27 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  35.58 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  35.93 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  36.77 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  36.88 
 
 
161 aa  111  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  36.67 
 
 
170 aa  111  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  34.59 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  34.59 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  41.88 
 
 
164 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>