180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2437 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  88.51 
 
 		 175 aa  330  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  88.51 
 
 		 175 aa  328  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  81.61 
 
 		 175 aa  306  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  74.29 
 
 		 178 aa  275  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  73.14 
 
 		 175 aa  274  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  73.14 
 
 		 175 aa  274  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  73.71 
 
 		 178 aa  274  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  76.47 
 
 		 175 aa  274  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  73.71 
 
 		 178 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  73.71 
 
 		 178 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  73.71 
 
 		 178 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  73.71 
 
 		 178 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  73.26 
 
 		 175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  74.12 
 
 		 174 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  73.14 
 
 		 178 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  73.14 
 
 		 178 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  73.14 
 
 		 178 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  73.53 
 
 		 175 aa  268  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  69.64 
 
 		 172 aa  253  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  69.05 
 
 		 169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  69.05 
 
 		 169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  69.05 
 
 		 169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  69.14 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  66.67 
 
 		 169 aa  238  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  65.48 
 
 		 168 aa  236  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  65.48 
 
 		 168 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  62.73 
 
 		 161 aa  228  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  65.85 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  63.98 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  63.98 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  63.35 
 
 		 165 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  63.35 
 
 		 165 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  63.35 
 
 		 165 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  63.98 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  62.73 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  62.73 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  62.73 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  62.73 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  62.73 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  62.73 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  62.73 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  62.73 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  62.11 
 
 		 165 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  60.57 
 
 		 175 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  51.23 
 
 		 162 aa  182  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  50.61 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  51.85 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  51.85 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  51.85 
 
 		 167 aa  177  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  45.96 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  44.65 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  40.83 
 
 		 172 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  46.54 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  45.28 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  43.21 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  43.75 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  36.09 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  38.99 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  41.25 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  41.25 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  38.46 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  39.88 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  40 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  40.62 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  37.74 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  38.75 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  38.51 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  41.51 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  42.77 
 
 		 164 aa  124  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  39.62 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  39.38 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  40.25 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  38.12 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  38.99 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  37.5 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  38.36 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  36.78 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  38.99 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  38.36 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  40.25 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  37.74 
 
 		 167 aa  118  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  36.25 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  35.58 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  36.53 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  36.88 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  39.62 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  37.11 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  35.67 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  37.11 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  38.71 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  40.62 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  36.02 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  38.36 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  36.02 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>