183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0177 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  100 
 
 
166 aa  347  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  47.85 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  47.85 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  47.85 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  46.63 
 
 
172 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  48.15 
 
 
175 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  50 
 
 
169 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  48.67 
 
 
175 aa  158  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  47.53 
 
 
175 aa  157  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  51.06 
 
 
168 aa  157  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  51.06 
 
 
168 aa  157  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  45.96 
 
 
165 aa  157  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  45.96 
 
 
174 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  45.96 
 
 
181 aa  156  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  46.3 
 
 
175 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  45.96 
 
 
178 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  45.96 
 
 
178 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  45.96 
 
 
178 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  45.96 
 
 
178 aa  154  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  45.96 
 
 
165 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  45.34 
 
 
175 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  45.96 
 
 
165 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  45.34 
 
 
178 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  43.9 
 
 
175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  45.34 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  45.34 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  45.34 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  45.34 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  44.1 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  45.34 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  48.97 
 
 
166 aa  151  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  45.34 
 
 
165 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  45.34 
 
 
165 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  45.34 
 
 
165 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  45.34 
 
 
165 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  45.34 
 
 
165 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  44.72 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  43.45 
 
 
162 aa  144  8.000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  42.24 
 
 
165 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  38.41 
 
 
167 aa  140  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  38.41 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  38.41 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  37.04 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  38.26 
 
 
175 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  40 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  40 
 
 
169 aa  117  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  35.06 
 
 
176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
171 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  37.24 
 
 
172 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  37.24 
 
 
170 aa  108  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 
171 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  36.65 
 
 
173 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
172 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  38.19 
 
 
172 aa  103  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  38.51 
 
 
166 aa  104  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 
174 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  36.81 
 
 
177 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  38.41 
 
 
167 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  33.75 
 
 
163 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 
171 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
165 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  37.93 
 
 
162 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  37.16 
 
 
167 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  36.02 
 
 
170 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  36.02 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  35.4 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
162 aa  99  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  38.52 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  31.06 
 
 
170 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  34.78 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  34 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  35.57 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  34.23 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  33.96 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  36.3 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  38.93 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  34.78 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  33.11 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  33.54 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  32.92 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  31.25 
 
 
171 aa  91.3  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  34.35 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0800  Ferritin Dps family protein  29.22 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  31.76 
 
 
176 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  32.3 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  37.3 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  33.59 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  32.3 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>