181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1307 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1307  ferritin  100 
 
 
173 aa  362  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  70.52 
 
 
172 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  69.94 
 
 
172 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  75.3 
 
 
171 aa  250  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  68.21 
 
 
176 aa  248  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  67.47 
 
 
173 aa  244  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  58.58 
 
 
176 aa  207  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  52.41 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  55.49 
 
 
171 aa  186  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  49.7 
 
 
177 aa  173  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  49.4 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  52.98 
 
 
172 aa  167  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  49.7 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  47.02 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  47.95 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  46.82 
 
 
173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  49.39 
 
 
164 aa  159  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  51.81 
 
 
186 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  50.6 
 
 
169 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  47.27 
 
 
175 aa  154  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  42.42 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  44.72 
 
 
164 aa  151  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  45.96 
 
 
165 aa  151  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  46.58 
 
 
164 aa  150  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  44.65 
 
 
167 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  45.45 
 
 
175 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  44.24 
 
 
175 aa  148  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  46.63 
 
 
163 aa  148  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  43.98 
 
 
170 aa  148  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  43.21 
 
 
164 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  50.3 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  43.2 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  46.58 
 
 
162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  43.86 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  44.44 
 
 
166 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  43.4 
 
 
167 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  42.86 
 
 
165 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  43.75 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  43.37 
 
 
170 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  45.57 
 
 
169 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  45.57 
 
 
169 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  45.57 
 
 
169 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  42.86 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  45.96 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  42.24 
 
 
161 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  42.86 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  42.86 
 
 
163 aa  137  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  47.34 
 
 
175 aa  136  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  42.77 
 
 
175 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  42.86 
 
 
163 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  42.5 
 
 
175 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  43.04 
 
 
176 aa  136  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  42.77 
 
 
175 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  38.61 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  43.11 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  44.52 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  42.86 
 
 
168 aa  134  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  42.86 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  43.4 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  42.04 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  40.48 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  42.77 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  39.02 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  42.14 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  41.88 
 
 
175 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
178 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  44.52 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  44.52 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  42.77 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  41.51 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  42.14 
 
 
178 aa  131  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  43.67 
 
 
166 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  44.52 
 
 
167 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  42.77 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  41.07 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  41.51 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  41.51 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  41.51 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  41.51 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  41.51 
 
 
178 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  41.51 
 
 
178 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  41.51 
 
 
178 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  40.99 
 
 
162 aa  128  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  40.72 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  41.88 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  42.5 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  42.5 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  41.25 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  41.88 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  41.88 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  41.88 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  41.88 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>