165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2235 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2235  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000308738  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3490  Ferritin Dps family protein  66.48 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3258  Ferritin, Dps family protein  71.7 
 
 
196 aa  225  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000744438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13875  bacterioferritin bfrB  62.09 
 
 
181 aa  220  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0082  Ferritin Dps family protein  62.28 
 
 
187 aa  217  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0171  Ferritin Dps family protein  57.61 
 
 
183 aa  214  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  62.64 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5419  Ferritin, Dps family protein  65.16 
 
 
181 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920475  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5039  Ferritin and Dps  64.52 
 
 
181 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5127  Ferritin, Dps family protein  64.52 
 
 
181 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1141  Ferritin, Dps family protein  60.61 
 
 
187 aa  204  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.406209  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3193  Ferritin Dps family protein  54.05 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  54.02 
 
 
182 aa  195  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5518  Ferritin Dps family protein  58.28 
 
 
177 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1471  Ferritin Dps family protein  48.24 
 
 
174 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1774  Ferritin, Dps family protein  50.88 
 
 
174 aa  167  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  40.96 
 
 
165 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  35.77 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  30.97 
 
 
162 aa  88.2  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  34.06 
 
 
167 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  34.06 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  34.06 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  34.71 
 
 
176 aa  85.1  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  36.75 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  31.47 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  30.72 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  31.65 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  29.29 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  34.62 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0800  Ferritin Dps family protein  31.15 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  33.61 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  28.06 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  29.85 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  35.51 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  35.51 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  33.57 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  28.48 
 
 
163 aa  72  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  31.39 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  30.94 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  26.47 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  34.38 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  34.06 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  31.16 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  26.81 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  27.22 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  27.81 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  27.27 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  29.2 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  31.16 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  27.54 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  27.66 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  30.32 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  27.78 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  34.06 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  34.06 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  26.81 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  34.06 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  34.06 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  29.41 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  33.33 
 
 
168 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  33.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  33.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  33.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  33.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  33.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  29.41 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  27.56 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  28.36 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  28.67 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  25 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  29.08 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  27.78 
 
 
477 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  27.74 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  26.98 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  26.98 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  26.98 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  31.43 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  25.36 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17741  Ferritin  25.19 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.970261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  25.16 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16343  ferritin  30 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.255913  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  29.77 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  30 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  28.69 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0212  ferritin  23.44 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08441  ferritin  23.44 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.786758  hitchhiker  0.00432039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  23.19 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  26.09 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  27.91 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17691  ferritin  26.24 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  26.15 
 
 
168 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  26.19 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  24.7 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  26.19 
 
 
172 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>