184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0016 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  100 
 
 
159 aa  327  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  47.77 
 
 
169 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  41.14 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  43.04 
 
 
175 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  43.04 
 
 
175 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  41.77 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  38.22 
 
 
174 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  38.82 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  38.82 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  38.61 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  37.82 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  40.13 
 
 
172 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  35.67 
 
 
163 aa  114  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  39.49 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  37.82 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  38.22 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  35.03 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  40.51 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  39.49 
 
 
176 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  36.84 
 
 
171 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  38.85 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  37.5 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  35.03 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  38.16 
 
 
164 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  37.58 
 
 
163 aa  107  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  35.44 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  37.58 
 
 
172 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  35.33 
 
 
167 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  39.49 
 
 
168 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  33.33 
 
 
165 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  35.53 
 
 
161 aa  103  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  33.97 
 
 
165 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  39.49 
 
 
168 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  34 
 
 
167 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  39.49 
 
 
168 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  36.94 
 
 
171 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  39.49 
 
 
168 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  39.74 
 
 
166 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  39.74 
 
 
166 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  33.76 
 
 
162 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  35.37 
 
 
164 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  38.12 
 
 
172 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  35.67 
 
 
177 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  39.49 
 
 
168 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  38.85 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  38.85 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  38.85 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  38.85 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  38.85 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  35.57 
 
 
168 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  35.57 
 
 
169 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  32.9 
 
 
165 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  35.1 
 
 
165 aa  100  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  33.54 
 
 
164 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  34.9 
 
 
172 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  32.9 
 
 
165 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  34.39 
 
 
176 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  33.54 
 
 
172 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  36.18 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  34.9 
 
 
168 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  31.82 
 
 
175 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  36.84 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  33.33 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  34.9 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  33.54 
 
 
168 aa  97.1  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  34.23 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  34.23 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  34.23 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  34.69 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  35.06 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  34.69 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  34.69 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  32.92 
 
 
477 aa  95.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  31.82 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  38.16 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  35.26 
 
 
162 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  39.47 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  34.21 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  39.62 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  30.97 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  34.18 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  30.32 
 
 
174 aa  90.5  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  33.55 
 
 
171 aa  90.5  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  30.97 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  36.94 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  30.57 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  30.57 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  30.57 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  33.13 
 
 
172 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>