168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3193 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3193  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
192 aa  393  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0082  Ferritin Dps family protein  63.03 
 
 
187 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5419  Ferritin, Dps family protein  61.54 
 
 
181 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920475  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5039  Ferritin and Dps  60.9 
 
 
181 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5127  Ferritin, Dps family protein  60.9 
 
 
181 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  57.56 
 
 
182 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13875  bacterioferritin bfrB  57.89 
 
 
181 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  53.8 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0171  Ferritin Dps family protein  52.87 
 
 
183 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1141  Ferritin, Dps family protein  58.33 
 
 
187 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.406209  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3490  Ferritin Dps family protein  51.72 
 
 
176 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2235  Ferritin Dps family protein  55.49 
 
 
184 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000308738  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3258  Ferritin, Dps family protein  56.77 
 
 
196 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000744438  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1471  Ferritin Dps family protein  46.75 
 
 
174 aa  158  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5518  Ferritin Dps family protein  47.53 
 
 
177 aa  150  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1774  Ferritin, Dps family protein  43.5 
 
 
174 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  45.39 
 
 
165 aa  132  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  34.33 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  39.83 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  39.83 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  31.16 
 
 
171 aa  84.7  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  31.34 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  33.05 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  29.5 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  31.16 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  34.33 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  34.33 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  36.51 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  30.07 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  35.82 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  31.03 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  34.43 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  31.47 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  30.58 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  34.33 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  29.71 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  27.78 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  33.09 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  27.03 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  27.15 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  33.33 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  27.08 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  26.35 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  30.56 
 
 
159 aa  72  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  35.88 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16343  ferritin  34.88 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.255913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  27.01 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  31.4 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0800  Ferritin Dps family protein  27.56 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  31.43 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  32.61 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  28.21 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17741  Ferritin  31.62 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.970261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  29.92 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  35.96 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  35.07 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  35.07 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  30.95 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  26.67 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  27.1 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  27.69 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  27.21 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  27.78 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  27.01 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  26.99 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  28.12 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  29.73 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  31.69 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  26.57 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  24.32 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  29.03 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  29.03 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  29.03 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  28.24 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  26.88 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  28 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  28 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  28 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  29.08 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  29.53 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  32.37 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  32.37 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  32.37 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  32.37 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  32.37 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  27.5 
 
 
171 aa  61.6  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  32.37 
 
 
168 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  26.88 
 
 
175 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  28.93 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  28.93 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  27.07 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  28.93 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  28.93 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  29.25 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  31.65 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  31.65 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  31.65 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>