181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2507 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
174 aa  358  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0800  Ferritin Dps family protein  55.29 
 
 
176 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  54.07 
 
 
172 aa  200  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  55.49 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  53.94 
 
 
175 aa  195  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  60.14 
 
 
155 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  44.38 
 
 
172 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  41.94 
 
 
171 aa  140  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  44.94 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  39.47 
 
 
161 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  35.9 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  37.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  39.35 
 
 
165 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  36.36 
 
 
178 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  35.9 
 
 
175 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  36.6 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  38.99 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  34.62 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  34.62 
 
 
175 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  35.67 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  33.95 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  32.69 
 
 
174 aa  111  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  34.81 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  32.9 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  35.19 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  35.19 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  35.19 
 
 
165 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  35.19 
 
 
165 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  35.19 
 
 
165 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  32.26 
 
 
175 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  35.8 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  35.8 
 
 
165 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  36.71 
 
 
167 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  35.19 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  32.3 
 
 
175 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  36.02 
 
 
167 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  40.99 
 
 
175 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  36.02 
 
 
167 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  37.09 
 
 
173 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  36.59 
 
 
166 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  36.71 
 
 
167 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  32.1 
 
 
169 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  36.02 
 
 
167 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  35 
 
 
164 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  37.33 
 
 
176 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  31.68 
 
 
162 aa  105  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  33.97 
 
 
175 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  38 
 
 
172 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  36.48 
 
 
171 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  36.25 
 
 
166 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  37.33 
 
 
172 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  35.85 
 
 
177 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  32.93 
 
 
169 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
176 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  32.93 
 
 
169 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  32.93 
 
 
169 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  32.1 
 
 
168 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  32.1 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  35.06 
 
 
163 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  34.59 
 
 
163 aa  101  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  36.54 
 
 
172 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  33.33 
 
 
171 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  31.48 
 
 
166 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  34.59 
 
 
163 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  35.22 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  35.29 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  36.05 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  32.08 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  36.36 
 
 
169 aa  98.2  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
164 aa  97.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  33.13 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  34.81 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  42.62 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  34.59 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  35.15 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  35.33 
 
 
171 aa  94.4  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  30.19 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  33.54 
 
 
171 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
162 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  37.16 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  34.18 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  32.28 
 
 
171 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  32.3 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  36.94 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  35.29 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>