186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1286 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1286  ferritin  100 
 
 		 160 aa  330  7.000000000000001e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  44.38 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  45.62 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  41.88 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  38.75 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  41.25 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  38.89 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  41.88 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  41.36 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  41.36 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  36.88 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  40 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  40.74 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  40 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  41.25 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  38.12 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  39.24 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  38.75 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  38.36 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  38.61 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  42.5 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  38.12 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  36.88 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  39.74 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  38.46 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  34.16 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  38.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  32.7 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  35 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  36.25 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  35 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  35.85 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  35.26 
 
 		 477 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  37.34 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  37.11 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  37.11 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  37.11 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  37.11 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  34.97 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  33.75 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  35.85 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  36.67 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  36.48 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  35.85 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 		 178 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  33.12 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  31.45 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  35.22 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  35.85 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  41.88 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  33.75 
 
 		 170 aa  94.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  34.38 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  36.54 
 
 		 172 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  33.12 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  34.59 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  37.65 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  36.71 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  33.75 
 
 		 170 aa  94  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  36.25 
 
 		 169 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  34.59 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  35.22 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  29.38 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  35.22 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  34.81 
 
 		 181 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  34.59 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  34.59 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  35.21 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  33.74 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  34.57 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  33.12 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  33.12 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  33.12 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 		 168 aa  87.4  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  35.21 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  32.7 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  35.21 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  35.21 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  30.92 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  32.05 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  31.58 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  32.85 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  33.1 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  34.53 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  32.91 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  32.48 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  31.33 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  31.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  31.33 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  31.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  31.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  31.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  31.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>