43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2113 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2113  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  100 
 
 		 158 aa  327  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.225555  decreased coverage  0.000458503 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.19 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000026689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.58 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000271809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4472  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4000  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.17 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3448  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  30 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3591  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.06 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000031905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3619  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0544  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03021  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3460  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3346  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02972  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0551  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3635  hypothetical protein  30.5 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.29 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.884169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3626  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3458  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3566  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3750  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3529  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.06 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2360  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.7 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3582  hypothetical protein  27.89 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0357  hypothetical protein  28.37 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0510  hypothetical protein  26.76 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1962  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.67 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0414  hypothetical protein  27.66 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0547  protein YhbP  30.22 
 
 		 133 aa  52  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4021  hypothetical protein  30.69 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3570  hypothetical protein  30.69 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3704  hypothetical protein  30.69 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1855  hypothetical protein  29.29 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1888  protein YhbP  27.7 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2157  protein YhbP  29.37 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1270  protein YhbP  24.24 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2212  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.89 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.291237  normal  0.0657107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0483  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.57 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0542  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  27.16 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>