35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0483 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0483  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  100 
 
 
142 aa  292  9e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1270  protein YhbP  48.87 
 
 
136 aa  131  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0547  protein YhbP  43.85 
 
 
133 aa  121  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1054  protein YhbP  44.78 
 
 
138 aa  116  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2157  protein YhbP  45.11 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1888  protein YhbP  44.96 
 
 
148 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3582  hypothetical protein  39.57 
 
 
151 aa  105  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0551  conserved hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02972  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3619  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0544  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3704  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3346  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3570  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03021  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3635  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3448  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4472  hypothetical protein  38.3 
 
 
147 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3591  hypothetical protein  38.85 
 
 
142 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3458  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0510  hypothetical protein  36.03 
 
 
144 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3626  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3566  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3529  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4021  hypothetical protein  35.25 
 
 
147 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3750  hypothetical protein  38.03 
 
 
150 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3460  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0357  hypothetical protein  37.14 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0414  hypothetical protein  38.57 
 
 
165 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1442  hypothetical protein  29.46 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1783  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1622  hypothetical protein  29.46 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.772658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0410  hypothetical protein  27.07 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2113  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  26.57 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2212  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.12 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.291237  normal  0.0657107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>