34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0357 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0357  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  322  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0414  hypothetical protein  87.5 
 
 		 165 aa  283  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3750  hypothetical protein  67.13 
 
 		 150 aa  210  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3582  hypothetical protein  63.01 
 
 		 151 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3704  hypothetical protein  55.71 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4021  hypothetical protein  55.71 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3570  hypothetical protein  55.71 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0510  hypothetical protein  52.11 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3448  hypothetical protein  56.52 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0551  conserved hypothetical protein  57.25 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02972  hypothetical protein  57.25 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0544  hypothetical protein  57.25 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03021  hypothetical protein  57.25 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3346  hypothetical protein  57.25 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3619  hypothetical protein  56.52 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3635  hypothetical protein  56.2 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4472  hypothetical protein  57.55 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3626  hypothetical protein  53.52 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3458  hypothetical protein  53.52 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3566  hypothetical protein  53.52 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3529  hypothetical protein  53.52 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3460  hypothetical protein  53.52 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3591  hypothetical protein  51.8 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0547  protein YhbP  36.5 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0483  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.14 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1270  protein YhbP  35.77 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1054  protein YhbP  39.26 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1888  protein YhbP  36.92 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2157  protein YhbP  34.31 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0410  hypothetical protein  32.12 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1442  hypothetical protein  26.52 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1783  hypothetical protein  26.52 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1622  hypothetical protein  26.52 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.772658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2113  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  28.37 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>