34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3448 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3448  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  306  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0551  conserved hypothetical protein  96.6 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0544  hypothetical protein  96.6 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02972  hypothetical protein  96.6 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03021  hypothetical protein  96.6 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3346  hypothetical protein  96.6 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3619  hypothetical protein  95.92 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3635  hypothetical protein  95.92 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4472  hypothetical protein  95.24 
 
 		 147 aa  291  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3529  hypothetical protein  82.31 
 
 		 147 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3566  hypothetical protein  82.31 
 
 		 147 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3458  hypothetical protein  82.31 
 
 		 147 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3626  hypothetical protein  82.31 
 
 		 147 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3460  hypothetical protein  80.95 
 
 		 147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3591  hypothetical protein  77.86 
 
 		 142 aa  238  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3750  hypothetical protein  58.74 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3582  hypothetical protein  61.15 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0357  hypothetical protein  56.52 
 
 		 153 aa  169  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0414  hypothetical protein  52.45 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0510  hypothetical protein  48.15 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4021  hypothetical protein  46.76 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3704  hypothetical protein  46.04 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3570  hypothetical protein  46.04 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0483  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.59 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1270  protein YhbP  34.81 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2157  protein YhbP  36.09 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1888  protein YhbP  34.35 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0547  protein YhbP  32.09 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1054  protein YhbP  33.33 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1783  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1442  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1622  hypothetical protein  29.77 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.772658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0410  hypothetical protein  27.41 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2113  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  30.5 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>