34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3570 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3570  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  310  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4021  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  308  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3704  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  308  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0510  hypothetical protein  64.58 
 
 
144 aa  209  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0357  hypothetical protein  55.71 
 
 
153 aa  178  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3582  hypothetical protein  56.94 
 
 
151 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0414  hypothetical protein  54.29 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3750  hypothetical protein  55.56 
 
 
150 aa  166  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396126  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3458  hypothetical protein  48.92 
 
 
147 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3566  hypothetical protein  48.92 
 
 
147 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3626  hypothetical protein  48.92 
 
 
147 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3529  hypothetical protein  48.92 
 
 
147 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3619  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3448  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0544  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02972  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0551  conserved hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3635  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3346  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03021  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3460  hypothetical protein  48.2 
 
 
147 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3591  hypothetical protein  44.85 
 
 
142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4472  hypothetical protein  45.32 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0483  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.97 
 
 
142 aa  104  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1888  protein YhbP  36.09 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0547  protein YhbP  30.6 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0410  hypothetical protein  35.51 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2157  protein YhbP  31.85 
 
 
135 aa  87.4  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1054  protein YhbP  35.56 
 
 
138 aa  87  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1270  protein YhbP  32.09 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1783  hypothetical protein  31.85 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1622  hypothetical protein  31.11 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.772658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1442  hypothetical protein  31.11 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2113  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  30.69 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>