165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2398 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2398  CoA-substrate-specific enzyme activase  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.77 
 
 
539 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.88 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.08 
 
 
263 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  39 
 
 
256 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.98 
 
 
272 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  35.29 
 
 
255 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  38.19 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.4 
 
 
260 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.03 
 
 
539 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.4 
 
 
262 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.45 
 
 
261 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.46 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.62 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  36.22 
 
 
256 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4881  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  34.38 
 
 
255 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  0.786718 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4562  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  34.38 
 
 
255 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.58 
 
 
275 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3729  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.38 
 
 
255 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367049  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4770  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  34.38 
 
 
255 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2520  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  37.11 
 
 
253 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.491002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.86 
 
 
272 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.3 
 
 
253 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4936  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.59 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.35 
 
 
263 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5848  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.59 
 
 
255 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.66 
 
 
261 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04203  predicted ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  33.59 
 
 
255 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3661  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.59 
 
 
255 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0497003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04166  hypothetical protein  33.59 
 
 
255 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.2 
 
 
269 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.27 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.86 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.55 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3879  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.35 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.59 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.74 
 
 
273 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0705  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.82 
 
 
269 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1279  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.87 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  39.37 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.5 
 
 
267 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.5 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1468  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.6 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0874  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator (2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A)  32.03 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25420  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  36.36 
 
 
248 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000315208  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.58 
 
 
267 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2772  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.83 
 
 
260 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11310  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  36.11 
 
 
247 aa  122  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.45767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2948  benzoyl-CoA reductase, subunit D  31.58 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1347  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.76 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.17 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  30.68 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0428  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  31.76 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215923  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1358  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.56 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.512731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1928  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.57 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  27.14 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1535  benzoyl-CoA reductase, subunit D  31.67 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.77 
 
 
251 aa  113  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1349  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.72 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00045569 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1133  putative CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  31.64 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000196227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1277  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.4 
 
 
259 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  35.29 
 
 
259 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.92 
 
 
242 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0727  benzoyl-CoA reductase, subunit D  29.92 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0604  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.12 
 
 
246 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.64 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1026  benzoyl-CoA reductase, subunit D  29.01 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.614624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0894  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.69 
 
 
256 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0253  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.11 
 
 
244 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3911  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.6 
 
 
264 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  28.29 
 
 
249 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2949  benzoyl-CoA reductase, subunit A  33.5 
 
 
438 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.91 
 
 
347 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.08 
 
 
330 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4398  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.46 
 
 
266 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1027  benzoyl-CoA reductase, subunit A  32.34 
 
 
437 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0726  benzoyl-CoA reductase, subunit A  31.48 
 
 
437 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.810305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1536  benzoyl-CoA reductase, subunit A  31.84 
 
 
437 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0392  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.84 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0386  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.44 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.45 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  28.35 
 
 
331 aa  95.9  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.03 
 
 
336 aa  95.9  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.96 
 
 
339 aa  95.5  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.1 
 
 
1036 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  29.28 
 
 
1503 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.95 
 
 
1444 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.11 
 
 
359 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.5 
 
 
329 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2727  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  29.5 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0496  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.26 
 
 
408 aa  92.4  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.17 
 
 
1343 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  28.08 
 
 
1461 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.13 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  28.57 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3624  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.71 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000071885  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  31.56 
 
 
319 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0251  methanogenesis marker protein 15  27.82 
 
 
413 aa  89  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.447207  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.51 
 
 
1137 aa  88.6  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>