37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1091 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1117    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  55 
 
 
558 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  54.5 
 
 
550 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  46.55 
 
 
551 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  46.18 
 
 
552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  34.23 
 
 
551 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  34.52 
 
 
551 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  31.5 
 
 
545 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  30.32 
 
 
548 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  27.83 
 
 
538 aa  180  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  30.56 
 
 
578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  28.85 
 
 
551 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  26.83 
 
 
545 aa  140  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  26.42 
 
 
547 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  25.48 
 
 
542 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  24.53 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  26.99 
 
 
586 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  24.03 
 
 
525 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  29.74 
 
 
624 aa  101  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  24.33 
 
 
509 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  23.45 
 
 
555 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  25.13 
 
 
477 aa  92.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  27.23 
 
 
517 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  25.27 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  20.56 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  26.07 
 
 
788 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  23.24 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  22.06 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  27.7 
 
 
649 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  25.09 
 
 
591 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  23.36 
 
 
536 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  24.83 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  22.03 
 
 
485 aa  54.7  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1101  hypothetical protein  26.03 
 
 
688 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  29.7 
 
 
484 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  29.5 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1791  hypothetical protein  27.41 
 
 
325 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000251959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>