33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1727 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1116    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  93.66 
 
 		 552 aa  1019    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  45.49 
 
 		 550 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  44.19 
 
 		 558 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  46.96 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  32.27 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  30.25 
 
 		 551 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  29.98 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  33.15 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  26.57 
 
 		 538 aa  200  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  29.56 
 
 		 578 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  28.12 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  28.12 
 
 		 542 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  25.39 
 
 		 545 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  27.71 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  24.18 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  23.39 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  23.76 
 
 		 509 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  24.53 
 
 		 550 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  28.44 
 
 		 477 aa  104  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  24.16 
 
 		 555 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  23.52 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  24.1 
 
 		 624 aa  87.8  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  24.56 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  24.6 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  24.84 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  25.5 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  22.81 
 
 		 519 aa  47.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  21.96 
 
 		 485 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  28.97 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  23.99 
 
 		 591 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  19.93 
 
 		 553 aa  43.5  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  22.16 
 
 		 501 aa  43.9  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>