27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1642 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  980    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  28.24 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  28.06 
 
 
517 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  28.63 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  27.47 
 
 
509 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  30.48 
 
 
591 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  23.84 
 
 
536 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  25.51 
 
 
550 aa  93.6  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  26.83 
 
 
558 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  26.16 
 
 
550 aa  77.4  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  18.77 
 
 
538 aa  76.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  22.44 
 
 
545 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  21.73 
 
 
555 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  24.25 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  23.5 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  25 
 
 
545 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  22.59 
 
 
551 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  22.29 
 
 
551 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  23.42 
 
 
542 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  20.74 
 
 
552 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  22.07 
 
 
624 aa  53.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  23.57 
 
 
477 aa  50.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  23.57 
 
 
548 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  23.03 
 
 
586 aa  47.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  21.5 
 
 
551 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  22.62 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  20.37 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>