34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1108    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  97.1 
 
 		 551 aa  1034    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  33.04 
 
 		 550 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  33.57 
 
 		 558 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  34.77 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  31.7 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  30.94 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  29.96 
 
 		 551 aa  236  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  30.43 
 
 		 548 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  31.75 
 
 		 578 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  29.08 
 
 		 551 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  30.83 
 
 		 538 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  30.7 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  27.84 
 
 		 545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  25 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  27.7 
 
 		 542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  26.53 
 
 		 586 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  24.95 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  25.6 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  21.58 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  21.86 
 
 		 624 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  24.94 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  22.91 
 
 		 521 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  22.76 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  23.33 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  25.54 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  25.65 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  26.63 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  22.79 
 
 		 591 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  29.91 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  22.88 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2739  hypothetical protein  24.18 
 
 		 328 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.21469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  24.84 
 
 		 649 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>