33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3422 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1124    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  68.1 
 
 		 550 aa  781    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  55.58 
 
 		 552 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  43.73 
 
 		 551 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  44.19 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 551 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  33.03 
 
 		 551 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  30.37 
 
 		 545 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  29.5 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  26.83 
 
 		 538 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  27.89 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  27.84 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  25.35 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  24.91 
 
 		 545 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  25.09 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  29 
 
 		 525 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  25.51 
 
 		 547 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  29.11 
 
 		 624 aa  94.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  23.68 
 
 		 550 aa  93.6  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  24.01 
 
 		 555 aa  90.1  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  24.87 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  22 
 
 		 509 aa  87.4  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  26.83 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  26.39 
 
 		 477 aa  83.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  20.81 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  23.71 
 
 		 591 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  25.38 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  26.26 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  23 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  37.89 
 
 		 788 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  29.85 
 
 		 461 aa  57  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  24.41 
 
 		 649 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  27.44 
 
 		 484 aa  43.9  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>