32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2491 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1117    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  93.66 
 
 		 551 aa  1024    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  46.07 
 
 		 550 aa  485  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  45.29 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  46.77 
 
 		 552 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  31.72 
 
 		 545 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  31.09 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  30.58 
 
 		 551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  31.7 
 
 		 548 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  25.86 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  27.88 
 
 		 578 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  28.26 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  27.55 
 
 		 586 aa  124  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  25.7 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  24.62 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  23.73 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  25.65 
 
 		 550 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  24.47 
 
 		 555 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  22.95 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  23.45 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  27.74 
 
 		 477 aa  92.8  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  23.63 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  30.23 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  23.67 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  24.53 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  22.95 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  24.5 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  27.52 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  19.93 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  22.47 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5443  hypothetical protein  22.05 
 
 		 661 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  25.09 
 
 		 649 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>