32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1827 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1095    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  29.41 
 
 		 551 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  29.42 
 
 		 551 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  31.02 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  26.85 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  27.85 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  26.96 
 
 		 552 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  28.32 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  25.7 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  28.14 
 
 		 558 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  28.94 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  26.78 
 
 		 542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  27.66 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  23.27 
 
 		 538 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  26.67 
 
 		 547 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  26.55 
 
 		 550 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  26.77 
 
 		 578 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  23.83 
 
 		 624 aa  105  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  21.67 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  25.22 
 
 		 509 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  26.01 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  25.17 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  25.75 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  30.16 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  22.56 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  24.56 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  24.84 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  24.84 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  21.93 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  26.05 
 
 		 591 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0217  hypothetical protein  25.68 
 
 		 397 aa  47.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  25.32 
 
 		 536 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>