29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2312 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1135    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  30.71 
 
 
550 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  29.86 
 
 
542 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  26.57 
 
 
586 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  24.91 
 
 
552 aa  97.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  23.18 
 
 
552 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  24.33 
 
 
551 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  23.59 
 
 
558 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  22.63 
 
 
545 aa  90.9  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  21.67 
 
 
551 aa  90.5  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  22.66 
 
 
545 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  21.12 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  22.86 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  21.01 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  21.89 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  25.53 
 
 
509 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  21.98 
 
 
492 aa  73.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  20.43 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  22.41 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  22.15 
 
 
551 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  22.01 
 
 
624 aa  62.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  21.16 
 
 
525 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  21.25 
 
 
538 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  32.53 
 
 
788 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  21.98 
 
 
536 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  22.91 
 
 
578 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  22.11 
 
 
521 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  25.56 
 
 
591 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  28.32 
 
 
473 aa  45.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>