19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1138 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1088    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  29.23 
 
 
591 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  27.13 
 
 
517 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  29.16 
 
 
521 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  24.95 
 
 
509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  25.09 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  23.84 
 
 
492 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  21.96 
 
 
545 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  23.22 
 
 
538 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  24.05 
 
 
586 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  26.46 
 
 
542 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  25.2 
 
 
555 aa  57  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  23.21 
 
 
550 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  25.08 
 
 
548 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  22.12 
 
 
551 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  29.63 
 
 
624 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  23.16 
 
 
547 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  23.3 
 
 
552 aa  44.3  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  22.47 
 
 
551 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>