12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1101 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1101  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1357    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5443  hypothetical protein  34.16 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  25.82 
 
 		 649 aa  260  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2300  hypothetical protein  27.87 
 
 		 727 aa  223  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3572  hypothetical protein  26.69 
 
 		 701 aa  195  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.433976  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3306  hypothetical protein  25.28 
 
 		 695 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1249  hypothetical protein  24.85 
 
 		 629 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.905075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3557  hypothetical protein  25.58 
 
 		 637 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  25.86 
 
 		 552 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  23.11 
 
 		 469 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  33.82 
 
 		 467 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  24.19 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>