More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3584 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3584  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
164 aa  337  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  95.12 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25.15 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  30.72 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  31.13 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.54 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  30.26 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.67 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  24.39 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  32.39 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.32 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  24.39 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  31.34 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.8 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  23.38 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  24.54 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.6 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.71 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  24.36 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.34 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.89 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  28.67 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.26 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  28.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  31.58 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.37 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.06 
 
 
435 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  28.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  30.83 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  32.59 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.92 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  25.87 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  31.94 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  25.15 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  25.87 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  25.87 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.39 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  25.87 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  25.87 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  24.48 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.32 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.71 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  30.65 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  28.89 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  25.95 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.34 
 
 
280 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.39 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.87 
 
 
598 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  25.17 
 
 
191 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  29.84 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0773  Redoxin domain protein  31.51 
 
 
323 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  31.47 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.65 
 
 
596 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  28.89 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  30.77 
 
 
198 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.67 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  30.89 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  28.89 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.67 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  23.97 
 
 
191 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.22 
 
 
188 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  33.62 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  33.62 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  36.29 
 
 
503 aa  61.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  33.62 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  33.62 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  33.62 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  30.23 
 
 
469 aa  61.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  33.62 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  33.62 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.85 
 
 
183 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  25.32 
 
 
174 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  25.68 
 
 
184 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.31 
 
 
181 aa  60.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  33.91 
 
 
178 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  29.1 
 
 
213 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.61 
 
 
191 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  33.91 
 
 
178 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  30.84 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  25.17 
 
 
437 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  28.89 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  33.62 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
433 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 
609 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.43 
 
 
404 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  29.1 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  31.34 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  30.33 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  27.22 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  30.3 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  24.05 
 
 
191 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>