102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0385 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0385  truncated transposase, ISL3 family  100 
 
 
108 aa  226  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00940288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0379  truncated transposase, ISL3 family  88.89 
 
 
110 aa  207  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.848485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0107  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0319  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0561  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0697  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1380  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1538  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2266  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2284  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2326  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00136305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2612  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2879  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3181  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4134  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.99 
 
 
413 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00235401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2462  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.25 
 
 
411 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0062  hypothetical protein  42.99 
 
 
213 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1248  ISL3 family transposase truncation  39.45 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.6 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.22 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.6 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.6 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  39.22 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0254  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.14 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0652  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.14 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0716  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.14 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0872  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.14 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.14 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1664  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.14 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2270  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.14 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2939  transposase  36.17 
 
 
371 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00230958  normal  0.013078 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.5 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.5 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.58 
 
 
421 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34 
 
 
431 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1148  hypothetical protein  34.91 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.98 
 
 
413 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2101  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.98 
 
 
413 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135516  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.29 
 
 
417 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0832  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.108641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1063  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1507  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1918  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1981  transposase  34.29 
 
 
411 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  28.04 
 
 
411 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3253  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.08 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.08 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.08 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.08 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0797  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.08 
 
 
417 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2342  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.08 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2456  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.08 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.352628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2079  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
566 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.674588  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.03 
 
 
411 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.03 
 
 
411 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.03 
 
 
411 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.71 
 
 
408 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  28.43 
 
 
406 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.46 
 
 
408 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.495823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1226  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.46 
 
 
408 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.46 
 
 
408 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90501  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2148  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.46 
 
 
408 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493226  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2200  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.46 
 
 
408 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240905  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.81 
 
 
411 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1922  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26 
 
 
323 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 
407 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.817062  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3683  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 
407 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188081  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03122  transposase  29.29 
 
 
322 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2351  hypothetical protein  39.58 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01111  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01375  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01504  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01568  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01758  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.339943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02212  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02786  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02978  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04079  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04311  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04734  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04847  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05630  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05742  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06103  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.600961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02426  ISXoo13 transposase  29.21 
 
 
411 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.71 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.71 
 
 
361 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7486  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
407 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>