78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0379 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0379  truncated transposase, ISL3 family  100 
 
 
110 aa  231  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.848485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0385  truncated transposase, ISL3 family  88.89 
 
 
108 aa  207  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00940288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1538  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2266  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2284  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2326  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00136305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2612  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2879  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3181  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4134  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00235401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1380  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0697  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0561  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0319  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0107  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.1 
 
 
413 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2462  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.18 
 
 
411 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0062  hypothetical protein  45.1 
 
 
213 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1248  ISL3 family transposase truncation  39.45 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0254  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.19 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0652  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.19 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0716  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.19 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0872  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.19 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.19 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1664  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.19 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2270  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.19 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.37 
 
 
441 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  37.37 
 
 
440 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.37 
 
 
441 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.37 
 
 
441 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.37 
 
 
441 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2939  transposase  36.17 
 
 
371 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00230958  normal  0.013078 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  36.54 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  36.54 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.29 
 
 
421 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1148  hypothetical protein  35.92 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  34.29 
 
 
411 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  34.29 
 
 
411 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  34.29 
 
 
411 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0832  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.108641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1063  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1507  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1918  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1981  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  34.29 
 
 
411 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.34 
 
 
431 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.58 
 
 
417 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 
413 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2101  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 
413 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135516  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.47 
 
 
411 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.47 
 
 
411 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.47 
 
 
411 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2079  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
566 aa  50.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.674588  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  29.63 
 
 
411 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0797  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2342  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2456  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.352628  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3253  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  30.77 
 
 
406 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.3 
 
 
411 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.68 
 
 
361 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.68 
 
 
406 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.72 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1922  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.84 
 
 
323 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1165  transposase  26.42 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2351  hypothetical protein  39.53 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3683  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.3 
 
 
407 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188081  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.3 
 
 
407 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.817062  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.92 
 
 
407 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>