22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5585 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  72.81 
 
 
219 aa  307  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  45.15 
 
 
210 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  47.15 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  45.77 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  44.28 
 
 
216 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  45.18 
 
 
212 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  45.05 
 
 
215 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  39.6 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  41.34 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  40.78 
 
 
234 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  40.78 
 
 
210 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  41.75 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  38.89 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  40.28 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  41.23 
 
 
219 aa  85.5  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  31.61 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  27.72 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  32.35 
 
 
144 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  27.81 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>