22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11898 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  69.44 
 
 
210 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  69.44 
 
 
234 aa  248  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  68.89 
 
 
210 aa  248  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  67.35 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  51.56 
 
 
207 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  48.72 
 
 
210 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  49.74 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  50 
 
 
216 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  48.54 
 
 
286 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  44.9 
 
 
212 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  47.94 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  36.22 
 
 
219 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  38.89 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  30.32 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  33.09 
 
 
143 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  27.75 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  34.57 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  35.82 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  25.17 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>