22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2390 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  89.81 
 
 		 216 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  60.4 
 
 		 210 aa  245  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  61.46 
 
 		 207 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  57.07 
 
 		 215 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  52.48 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  49.28 
 
 		 212 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  47.67 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  48.54 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  49.74 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  50.54 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  45.77 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  47.6 
 
 		 210 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0424443 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  39.31 
 
 		 219 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  37.93 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  27.18 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  32.67 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  32.37 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>