21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2382 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  296  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  49.26 
 
 
144 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  42.28 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  33.83 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  29.85 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  31.58 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  34.62 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  32.82 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  32.23 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  32.82 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  33.88 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  42.17 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  35.2 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  30.4 
 
 
210 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  39.81 
 
 
215 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  37.9 
 
 
212 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  31.75 
 
 
216 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.02 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  29.41 
 
 
191 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>