23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3332 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  45.29 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  39.38 
 
 		 204 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  33.14 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  33.14 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  32.35 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  33.14 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  35.93 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  31.91 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  31.61 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  32.47 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  31.22 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  32.34 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  30.59 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  27.96 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  29.03 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.1 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  38.1 
 
 		 218 aa  42  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>