22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0950 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0950  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.27275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5585  hypothetical protein  72.81 
 
 		 220 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2021  hypothetical protein  44.17 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0587902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4833  hypothetical protein  47.67 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2390  hypothetical protein  47.67 
 
 		 286 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2528  hypothetical protein  44.78 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1590  hypothetical protein  44.93 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05210  hypothetical protein  46.32 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.727237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2804  hypothetical protein  38.55 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2821  hypothetical protein  38.55 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.684347  decreased coverage  0.0080131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2777  hypothetical protein  38.55 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3337  hypothetical protein  39.81 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0424443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4809  endonuclease III-like protein  40.21 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11898  hypothetical protein  36.22 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10025  conserved hypothetical protein  29.12 
 
 		 327 aa  95.1  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2264  hypothetical protein  36.6 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174055  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3332  hypothetical protein  32.48 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2120  hypothetical protein  33.99 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135529  normal  0.027957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2382  hypothetical protein  33.83 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.0337893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1295  putative cytoplasmic protein  29.59 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00243456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2996  hypothetical protein  31.71 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>